| Title: | Citlivostní analýza metod identifikace haplotypů |
| Other Titles: | The sensitivity analysis of haplotype identification methods |
| Authors: | Vonášek, Adam |
| Advisor: | Houdová, Lucie |
| Issue Date: | 2014 |
| Publisher: | Západočeská univerzita v Plzni |
| Document type: | bakalářská práce |
| URI: | http://hdl.handle.net/11025/15258 |
| Keywords: | transplantace kostní dřeně;krvetvorné buňky;HLA;HLA typizace;alela;haplotyp;genotyp;Clarkův algoritmus;EM algoritmus |
| Keywords in different language: | bone marrow transplantation;haematopoietic stem cells;HLA;HLA typing;allele;haplotype;genotype;Clark algorithm;EM algorithm |
| Abstract: | Práce se zabývá citlivostní analýzou metod pro identifikaci haplotypů. V teoretické části jsou obsaženy základní poznatky o transplantaci krvetvorných buněk, reakcích imunitního systému na ni, informace o HLA ("Human leucocyte antigens") znacích, způsobech typizace HLA znaků, a teoretický rozbor metod identifikace haplotypů, tj. Clarkova, EM ("Expectation-Maximization") a Bayesova algoritmu. Praktická část je věnována implementaci dvou zvolených algoritmů v prostředí programovacího jazyka Java, jejich výsledkům a zhodnocení, co se týče předností a nedostatků, které jsme stanovili na základě implementace. Na konci práce se nachází výkladový slovník pojmů. |
| Abstract in different language: | The work deals with a haplotype identification methods sensitivity analysis. A theoretical section should provide basic facts about haematopoietic stem cells transplantation, following reactions of immune system, HLA ("Human leucocyte antigens") types, methods for typing and a theoretical analysis of the haplotype identification methods, i.e. Clark, Expectation-Maximization and Bayes algorithm. A practical section focuses on two elected methods implementation using the computer programming language Java, results and an evaluation on advantages and disadvantages derived by the implementation. There is a monolingual dictionary at the end of the work. |
| Rights: | Plný text práce je přístupný bez omezení. |
| Appears in Collections: | Bakalářské práce / Bachelor´s works (KKY) |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| BP_Vonasek_15_5_2014.pdf | Plný text práce | 1,79 MB | Adobe PDF | View/Open |
| Vonasek-v.pdf | Posudek vedoucího práce | 3,93 MB | Adobe PDF | View/Open |
| Vonasek-p.pdf | Průběh obhajoby práce | 1,44 MB | Adobe PDF | View/Open |
Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11025/15258Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.