| Title: | Charakterizace off-target aktivace v mezibuněčných komunikačních sítích |
| Other Titles: | Characterisation of off-target activation in cell-cell signal transmission networks |
| Authors: | Kasl, Hynek |
| Advisor: | Georgiev Daniel, Doc. PhD. |
| Referee: | Vignoni Alejandro, MSc. PhD. |
| Issue Date: | 2016 |
| Publisher: | Západočeská univerzita v Plzni |
| Document type: | diplomová práce |
| URI: | http://hdl.handle.net/11025/23644 |
| Keywords: | mezibuněčná komunikace;matematické modelování;optimalizace;pravidla návrhu;kladná zpětná vazba |
| Keywords in different language: | intercellular communication;mathematical modelling;design optimization;design rules;positive feedback |
| Abstract: | Studium mezibuněčné komunikace je důležitou oblastí biologie. Důmyslně navržené komunikační sítě lze nalézt v organismech od bakterií po savce. Přesto není moc známo o způsobu jejich návrhu. Tato práce uvádí novou metodu modelování zaměřenou na optimalizaci těchto sítí. Navržená metoda je použita při optimalizaci tří biologicky odlišných případů jednokrokové homogenní komunikační sítě. Je ukázáno, že použití pozitivní zpětné vazby je výhodné pro rychlou a přesnou komunikaci. Nastavení síly zpětné vazby je dále diskutováno. Získané výsledky jsou porovnány s příklady použití zpětné vazby v bakteriálních quorum sensing sítích. |
| Abstract in different language: | Intercellular communication is an important field of study in biology. Intricately designed communication networks are found in organisms ranging from bacteria to mammals, yet not much is known about the design behind them. This work proposes a novel modelling method focused on optimization of communication networks. The proposed method is used to optimize the performance of a one-step communication network, with three biologically different cases considered. It is shown that designs utilizing positive feedback yield the best performance, and the feedback setup is discussed. A biological parallel to the derived results is found in the use of positive feedback in bacterial quorum sensing. |
| Rights: | Plný text práce je přístupný bez omezení. |
| Appears in Collections: | Diplomové práce / Theses (KKY) |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| Kasl-Master-Thesis.pdf | Plný text práce | 623,26 kB | Adobe PDF | View/Open |
| kasl-v.pdf | Posudek vedoucího práce | 762,1 kB | Adobe PDF | View/Open |
| kasl-o.pdf | Posudek oponenta práce | 598,81 kB | Adobe PDF | View/Open |
| kasl-p.pdf | Průběh obhajoby práce | 452,75 kB | Adobe PDF | View/Open |
Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11025/23644Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.