| Název: | Paralelizace geometrických výpočtů pro analýzu biomolekul |
| Autoři: | Löffelmann, Václav |
| Vedoucí práce/školitel: | Maňák Martin, Mgr. Ph.D. |
| Oponent: | Majdišová Zuzana, Ing. Bc. |
| Datum vydání: | 2016 |
| Nakladatel: | Západočeská univerzita v Plzni |
| Typ dokumentu: | bakalářská práce |
| URI: | http://hdl.handle.net/11025/23828 |
| Klíčová slova: | opencl;connolly surface;molekulární povrch;gpu |
| Klíčová slova v dalším jazyce: | opencl;connolly surface;molecular surface;gpu |
| Abstrakt: | Bakalářská práce se zabývá paralelním výpočtem molekulárního povrchu v programovacím jazyku OpenCL. Nová implementace dosahuje až 60% zrychlení pro nejobjemnější výpočty. V úvodní části je probrána nezbytná teorie Voronoi diagramů a jejich duální struktury. Následuje shrnutí současné implementace a popis nové, paralelní. V závěru nechybí detailní porovnání výsledků obou implementací napříč různými testovacími daty. |
| Abstrakt v dalším jazyce: | This work examines parallel implementation of exploring the molecular surface. The new implementation is in OpenCL language and improves current implementation by 60% for largest datasets. Initial part sums up a theory about Voronoi diagrams and its dual structure. Following parts targeting difference between current and new - parallel - implementation. At the end are presented detailed results and a comparison of both implementations. |
| Práva: | Plný text práce je přístupný bez omezení. |
| Vyskytuje se v kolekcích: | Bakalářské práce / Bachelor´s works (KIV) |
Soubory připojené k záznamu:
| Soubor | Popis | Velikost | Formát | |
|---|---|---|---|---|
| bp-loffelmann.pdf | Plný text práce | 1,66 MB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| A13B0376P-posudek.pdf | Posudek oponenta práce | 617 kB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| A13B0376P-hodnoceni.pdf | Posudek vedoucího práce | 184,82 kB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| A13B0376P-obhajoba.pdf | Průběh obhajoby práce | 192,79 kB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
Použijte tento identifikátor k citaci nebo jako odkaz na tento záznam:
http://hdl.handle.net/11025/23828Všechny záznamy v DSpace jsou chráněny autorskými právy, všechna práva vyhrazena.