Full metadata record
DC poleHodnotaJazyk
dc.contributor.advisorHoudová Lucie, Ing. Ph.D.
dc.contributor.authorStaníček, David
dc.contributor.refereeJani Filip, Ing.
dc.date.accepted2023-6-20
dc.date.accessioned2024-01-08T23:11:19Z-
dc.date.available2022-10-17
dc.date.available2024-01-08T23:11:19Z-
dc.date.issued2023
dc.date.submitted2023-5-29
dc.identifier93424
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/55045-
dc.description.abstractTato práce se zabývá vytvořením nástroje pro automatické hodnocení zarovnávacích nástrojů pro data, která jsou výstupem sekvenačních systémů nové generace (NGS). V první části jsou shrnuty základní teoretické poznatky o získávání těchto dat. Dále jsou shrnuty některé nástroje a jejich vlastnosti a aktuální situace poznání v tomto směru. V další části jsou definovány hodnotící metriky, poté následuje sada experimentů spolu s výsledným zhodnocením konkrétních nástrojů. Cílem této práce je vytvořit nástroj, který automaticky podrobuje zarovnávací software zkouškám za účelem zhodnocení jejich výkonu, předností a nedostatků.cs
dc.format45 s.
dc.language.isocs
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plzni
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezení
dc.subjectngscs
dc.subjectdna datacs
dc.subjectzarovnání ngs datcs
dc.subjectautomatické hodnocenícs
dc.subjecteditační vzdálenostcs
dc.subjectngs zarovnávací nástrojecs
dc.titleAutomatické měření metrik NGS zarovnávacích nástrojůcs
dc.title.alternativeAutomatic measurement of metrics of NGS alignment toolsen
dc.typebakalářská práce
dc.thesis.degree-nameBc.
dc.thesis.degree-levelBakalářský
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných věd
dc.thesis.degree-programKybernetika a řídicí technika
dc.description.resultObhájeno
dc.description.abstract-translatedThis work deals with the creation of a tool for automatic evaluation of alignment tools for data generated by next-generation sequencing (NGS) systems. The first part provides a summary of the basic theoretical knowledge about obtaining such data. It further summarizes some tools and their characteristics, as well as the current state of knowledge in this field. The next part defines evaluation metrics, followed by a series of experiments and the resulting assessment of specific tools. The outcome of this work is a tool that automatically subjects alignment software to tests to evaluate their performance, strengths, and weaknesses.en
dc.subject.translatedngsen
dc.subject.translateddna dataen
dc.subject.translatedngs data alignmenten
dc.subject.translatedautomatic evaluationen
dc.subject.translatedediting distanceen
dc.subject.translatedngs alignment toolsen
Vyskytuje se v kolekcích:Bakalářské práce / Bachelor´s works (KKY)

Soubory připojené k záznamu:
Soubor Popis VelikostFormát 
BP_Stanicek_David_NGS.pdfPlný text práce5,78 MBAdobe PDFZobrazit/otevřít
PosudekOponentaSTAG.pdfPosudek oponenta práce66,24 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
PosudekVedoucihoSTAG.pdfPosudek vedoucího práce60,47 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
Prubeh obhajoby Stanicek.pdfPrůběh obhajoby práce84,54 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
Zobrazit minimální záznam Zobrazit statistiky


Použijte tento identifikátor k citaci nebo jako odkaz na tento záznam: http://hdl.handle.net/11025/55045

Všechny záznamy v DSpace jsou chráněny autorskými právy, všechna práva vyhrazena.

hledání
navigace
  1. DSpace at University of West Bohemia
  2. Vysokoškolské kvalifikační práce / Theses
  3. Fakulta aplikovaných věd / Faculty of Applied Sciences
  4. Katedra kybernetiky / Department of Cybernetics
  5. Bakalářské práce / Bachelor´s works (KKY)